Ton commit sur master est toujours sur master, mais tes branches ont divergé.
C'est en fait le principe d'un arbre, les branches se divisent et chacune contient de nouvelles choses.
Le merge va en effet fusionner une branche vers l'autre, donc réunir les commits des deux, ça apparaîtra effectivement dans le log.
L'autre solution c'est de rebaser, pour que ta seconde branche diverge après la nouvelle fonctionnalité apportée sur master.
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