erreur dans un doctest

14 mai 2011 à 16:05:56

Bonjour

J'ai écris un petit module pour me simplifier l'impression de block data dans un fichier avec un format. J'ai essayé de faire un doctest pour la fonction et ça ne fonctionne pas, j'ai une erreur lorsque j'exécute le fichier.

Voici le module :

#/usr/bin/python
# -*- coding=utf-8 -*-

import doctest
import os

def datatofile( blockdata, fichier = "data.dat", dataformat = "empty", header = "" ):
    """ Print data into file 'fichier' 

    >>> data = [ range(2) for i in range(3) ]
    >>> datatofile.datatofile( data, "doctest_data.dat", "1x3d;1x2d")
    >>> f = open("doctest_data.dat","r")
    >>> f.read()
    '# file written with datatofile module : doctest_data.dat\n#\n  0  1\n  0  1\n  0  1\n'

    """

    # read format
    if dataformat == "empty":
        dataformatlist = [ "{:15g}" if isinstance(d,int) or isinstance(d,float) else "{:>15s}" for d in blockdata[0]]

    else:
        dataformatinfo = dataformat.replace(" ", "").split(";")
        dataformatlist = list()
        for datafmt in dataformatinfo:
            try:
                nfmt = int(datafmt.split("x")[0])
            except ValueError:
                print("\nError : in first you have to give a number")
                print("format for data is           : {0}".format(dataformat))
                print("format should be in the form : 1x5d;4x8.3f")
                return

            fmt = datafmt.split("x")[1] 
            for i in range(nfmt):
                dataformatlist.append("{:" + fmt + "}")

        # check format info and data length
        if len(dataformatlist) != len(blockdata[0]):
            print("\nError : too many or not enought format information")
            print("Number of data   : {0}".format(len(blockdata[0])))
            print("Number of format : {0}".format(len(dataformatlist)))
            return

    # file exist ?
    answer = ""
    while answer != "y":
        if os.path.exists( fichier ):
            answer = raw_input("File {0} exists, overwrite it ? (y/n) : ".format(fichier)).lower()
        else:
            answer = "y"

        if answer == "n":
            fichier = raw_input("Enter a new file name : ")
        elif answer == "y":
            continue
        else:
            print("hit 'y' for yes or 'n' for no")

    # open file and write header
    fout = open( fichier, "w")
    fout.write("# file written with datatofile module : {0}\n".format(fichier))
    fout.write(header)
    fout.write("#\n")

    for dataline in blockdata:
        try:
            line = " ".join([ fmt.format(data) for data, fmt in zip(dataline, dataformatlist) ])
        except ValueError:
            print("\nError : data and format unconsistant")
            print("Data format list :")
            print(dataformatlist)
            print("Line of data which gives the error :")
            print(dataline)
            return
        fout.write(line + "\n")

    fout.close()

if __name__ == "__main__":
    doctest.testmod()

Et voici l'erreur :

> python --version
Python 2.7.1+

> python datatofile.py
Traceback (most recent call last):
  File "datatofile.py", line 81, in <module>
    doctest.testmod()
  File "/usr/lib/python2.7/doctest.py", line 1850, in testmod
    for test in finder.find(m, name, globs=globs, extraglobs=extraglobs):
  File "/usr/lib/python2.7/doctest.py", line 865, in find
    self._find(tests, obj, name, module, source_lines, globs, {})
  File "/usr/lib/python2.7/doctest.py", line 919, in _find
    globs, seen)
  File "/usr/lib/python2.7/doctest.py", line 907, in _find
    test = self._get_test(obj, name, module, globs, source_lines)
  File "/usr/lib/python2.7/doctest.py", line 991, in _get_test
    filename, lineno)
  File "/usr/lib/python2.7/doctest.py", line 610, in get_doctest
    return DocTest(self.get_examples(string, name), globs,
  File "/usr/lib/python2.7/doctest.py", line 624, in get_examples
    return [x for x in self.parse(string, name)
  File "/usr/lib/python2.7/doctest.py", line 586, in parse
    self._parse_example(m, name, lineno)
  File "/usr/lib/python2.7/doctest.py", line 656, in _parse_example
    lineno + len(source_lines))
  File "/usr/lib/python2.7/doctest.py", line 742, in _check_prefix
    (lineno+i+1, name, line))
ValueError: line 8 of the docstring for __main__.datatofile has inconsistent leading whitespace: '#'

J'ai l'impression que quelque chose le gène avec les # dans le doc test. J'ai essayé de les remplacer par autre chose mais ça me donne la même erreur.

Bien entendu si vous avez d'autres remarques sur la fonction ça m'intéresse aussi

Anonyme

14 mai 2011 à 17:40:43

c'est les '\n' dans ton doctest qu'il aime pas, il faut les virer

Dans un doctest, tu écris comme dans un texte

met ton code en mode secret

ladgalen

14 mai 2011 à 22:27:03

Comment je peux faire pour les virer ? Les retour à la ligne sont importants et font partie du résultats.

Je ne comprend pas ce que tu veux dire par "dans un doctest, tu écris comme dans un texte". Il faut passer à la ligne à chaque \n ?

J'ai essayé avec ça :

""" Print data into file 'fichier' 

    >>> data = [ range(2) for i in range(3) ]
    >>> datatofile( data, "doctest_data.dat", "1x3d;1x2d")
    >>> f = open("doctest_data.dat","r")
    >>> f.read()
    # file written with datatofile module : doctest_data.dat
    #
      0  1
      0  1
      0  1


    """

J'ai eu ça :

> python datatofile.py
**********************************************************************
File "datatofile.py", line 13, in __main__.datatofile
Failed example:
    f.read()
Expected:
    # file written with datatofile module : doctest_data.dat
    #
      0  1
      0  1
      0  1
Got:
    '# file written with datatofile module : doctest_data.dat\n#\n  0  1\n  0  1\n  0  1\n'
**********************************************************************
1 items had failures:
   1 of   4 in __main__.datatofile
***Test Failed*** 1 failures.

Lui dans le résultat il a bien les \n.

J'ai mis mon code en secret, c'est pour minimiser le post que tu me demandes ça ?

Merci pour ton aide

Anonyme

14 mai 2011 à 23:37:59

essai voir ceci

def datatofile( blockdata, fichier = "data.dat", dataformat = "empty", header = "" ):
   """ Print data into file 'fichier' 
    >>> data = [ range(2) for i in range(3) ]
    >>> datatofile.datatofile( data, "doctest_data.dat", "1x3d;1x2d")
    >>> f = open("doctest_data.dat","r")
    >>> f.read()
    '#file written with datatofile module : doctest_data.dat
    #0  1
     0  1
     0  1'
   """

Oui secret pour diminuer la taille du post

question : pourquoi les \n dans un commentaire? si j'ai bien compris car les doctests c'est pas ce que j'utilise tous les jours

Trias

30 juillet 2011 à 12:30:29

Désolé de remonter un vieux sujet, il suffit d"échaper" tes retours à la ligne dans tes résultats:

'# file written with datatofile module : doctest_data.dat\\n#\\n  0  1\\n  0  1\\n  0  1\\n'

J'ai eut le même problème récemment et je l'ai résolut de cette manière.

En espérant t'avoir aidé.