Bonjpur tous le monde , merci de me repondre sur cette quesion :

que sont les fichiers dans le nom commence par le caractère ''.'' 

Bonjour ! En général ce sont des fichiers de configuration;

Filesystem Hierarchy Standard a écrit:

User specific configuration files for applications are stored
in the user's home directory in a file that starts with the '.'
character (a "dot file").
[...]

il y a d'autres implications.

comparez command ls ~  et command ls -A ~

pourquoi les sorties sont-elles différentes ?

généralement les fichiers sous linux qui commencent par un point c'est des fichiers cachés tous simplement.

avec la commande ls -l on ne les perçoit pas.

avec la commande ls -a  "-a" est une option pour dire all tous les fichiers même cachés .